Окончил Ставропольскую православную духовную семинарию в 2004 году и поступил в Московский государственный университет на востоковедение (Институт стран Азии и Африки МГУ).

Окончил бакалавратуру ИСАА МГУ в 2008 году, потом поступил в магистратуру, окончил ее в 2010 году. Знаток арабской поэзии.

В сентябре 2010 года был рукоположен в сан диакона, а в феврале 2011 — во священника.

Преподавательская деятельность

С 2010 года преподавал в Ставропольской православной духовной семинарии. В 2012 году там было решено открыть кафедру исламоведения. Отец Иоанн считал это необходимым, но не все были согласны с ним. Кафедра не получала ни финансирования, ни административной поддержки и осенью 2015 года была упразднена.

Вот что рассказал отец Иоанн о себе в интервью «Кавказскому геополитическому клубу» в августе 2016 года: «Я выпускник Ставропольской духовной семинарии, выпускник Института стран Азии и Африки МГУ, магистр востоковедения. По специальности арабист. Сфера моих научных интересов — исламоведение и в особенности корановедение как основа и позвоночник любого направления в исламоведении. Пять лет был преподавателем Ставропольской семинарии, из них четыре года возглавлял кафедру исламоведения.

Летом 2016 года переехал в Казань, где митрополитом Казанским и Татарстанским Феофаном мне было поручено возглавить новообразованную кафедру исламоведения в Казанской семинарии».

Об исламоведении

На вопрос, для чего нужно исламоведение, в частности, в духовном учебном заведении, отец Иоанн ответил: «Это нужно для того, чтобы лучше понимать сограждан, живущих с тобой бок о бок, но имеющих другой культурный код, другую систему ценностей и убеждений. Человек, ценностные ориентиры и поведение которого тебе понятны, уже не вызывает никаких фобий, исчезает или, по крайней мере, уменьшается уровень отчуждения, иногда даже враждебности».

В 2015 году выпустил монографию «Богословские основания для межрелигиозного диалога в исламской традиции».

Отец Иоанн рассказывает: «...встал вопрос издания работы, и, несмотря на то, что Ученый совет и администрация семинарии решили ее издать, дальше решения дело не продвинулось. Спонсоры, даже те, кто щедро жертвовал на строительство храмов и часовен, на издательскую деятельность денег не дали, несмотря на то, что деньги, необходимые на издание, были просто грошами в сравнении с тем, что они давали на строительство. Очевидно, так случилось вследствие непонимания важности науки и просвещения в деятельности Церкви, а также потому, что забываем простую истину — мы созидаем сердца, а не кирпичные кладки, которые легко рушатся, как это показал 1917 год.

Как тут не вспомнить великого арабского поэта Абу Аля аль-Маарри (973–1057), сказавшего:

…Люди двух сортов на земле:

Одни ваяют замки из камня,

другие сердца созидают человеческие.

Возможно, работа не была бы издана вовсе, если бы не помощь архиепископа Пятигорского и Черкесского Феофилакта».

В 2015 году прошла презентация этой работы отца Иоанна Васильева в Институте Востоковедения РАН. Монография получила несколько положительных отзывов известных отечественных востоковедов.